根據(jù)《深圳市人居環(huán)境委員會關于發(fā)布深圳市人居環(huán)境委員會審批環(huán)境影響評價文件的建設項目名錄（2013年本）的通知》，市環(huán)境保護行政主管部門負責審批下列建設項目環(huán)境影響評價文件（按規(guī)定須報國家和省環(huán)境保護行政主管部門審批的除外）：
1、列入年度市重大項目、列入市政府并聯(lián)審批項目（在區(qū)環(huán)保部門相關電子系統(tǒng)完善前）；
2、按規(guī)定應當編制環(huán)境影響報告書的電力、水利、石油、天然氣、化工、輕工、紡織化纖、汽車、船舶、電子、制藥（化學藥品制造除外）、選礦、非金屬礦開采、水泥粉磨站、高速公路、軌道交通、水運、生活垃圾處理處置、醫(yī)療廢物處理處置、污泥處理處置、日處理規(guī)模5萬噸以上污水處理等項目；
3、按規(guī)定應當編制環(huán)境影響報告書的占用飲用水源保護區(qū)、市級以上自然保護區(qū)或《廣東省環(huán)境保護規(guī)劃》生態(tài)嚴控區(qū)的項目；
4、跨區(qū)級行政區(qū)域的項目；
5、可能造成跨區(qū)級行政區(qū)域環(huán)境不良影響，有關環(huán)保部門對環(huán)境影響評價結論有爭議的項目；
6、市管污染源名單內(nèi)企業(yè)的新、擴、改及變更項目；
7、在經(jīng)審批的重污染行業(yè)統(tǒng)一定點基地內(nèi)建設的印染（設漂染工序）和電鍍（含配套電鍍工序）項目，以及陽極氧化、新增工業(yè)廢水日均排放量超過500噸等可能造成較大環(huán)境影響的項目；
8、規(guī)模為20蒸噸/小時及以上鍋爐（余熱利用、電鍋爐除外）；
9、銷售、使用IV類、V類放射源及生產(chǎn)、銷售、使用III類射線裝置的核技術應用項目，110千伏以上、220千伏以下送（輸）電項目和跨區(qū)的變電項目，廣播電視發(fā)射臺、無線電臺、雷達系統(tǒng)等按規(guī)定應編制環(huán)境影響報告表的電磁輻射項目；
10、申請上市項目，編制環(huán)境影響報告表的需開展環(huán)保核查的上市企業(yè)募集資金投向項目。
市東深水源保護辦公室負責審批觀瀾河流域內(nèi)由市環(huán)境保護行政主管部門審批的建設項目環(huán)境影響評價文件和深圳水庫——東深供水渠流域水源保護區(qū)（地表徑流直接進入深圳水庫和東深供水渠的流域范圍）內(nèi)建設項目的環(huán)境影響評價文件。